生物質鍋爐在長期停用的時候，需要十分注其爐體外部的防腐蝕保養的問題，首先其鍋停爐冷卻后，在進行使用時必須要徹底清除熱面的積灰和爐排上部、爐體下部的灰渣。然后要保持煙道有一定的自然通風。一般情況下，為了防潮應在爐膛、煙道中放置干燥劑。如以生石灰作為干燥劑，則每立方米爐膛或煙道內一般應放置3kg左右。放置后應嚴密關閉所有的通風門。生石灰變粉后要更換。如生物質鍋爐房位置低洼，停爐期間地面泛潮嚴重時，則應采用經常小火烘烤和放置干燥劑相結合的辦法。如果生物質鍋爐停爐時間很長，在徹底清除煙灰后在爐體金屬外表面涂以紅丹油或其它防腐漆。
生物質鍋爐的干法保養時要注意以下幾點問題：干燥劑不要直接接觸生物質鍋爐金屬表面，可裝在鐵盤等容器內放置干燥劑后，要關嚴手孔和其它孔蓋，汽、水管道上的閥門必須截斷生石灰變粉應及時更換。
生物質鍋爐濕法保養時，要注意爐水最好用凝結水，其次可用原有的爐水，再次是軟化水加堿后，爐水用微火加熱至80-100℃壓力升至2-3表壓后保護2-3小時，使其循環達到爐水堿度均衡，壓力降低時，再把爐水加滿，造成1.5 4表壓，并在整個保養期間一直保持這’堿度應定期化驗，降低時，應隨時補充冬天濕法保養要注意防凍，特別是排污通道和省煤器部分生物質鍋爐重新使用前應全部放出鍋內堿水最好備儲液池，以利再用。同時須用凈水沖洗。
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